文久三年倒幕派擊敗了佐幕派刀劍的時代宣告結束―――幕末時代　　作為刀劍男士的堀川國廣和曾經一同被主人用作戰斗武器的和泉守兼定奔跑在雨中的山路　　刀劍男士在審神者的激勵下開啟了付喪神的道路他們的使命是將企圖改變歷史的時間溯行軍打倒以守護“正確的歷史”　　與陸奧守吉行、藥研藤四郎、蜻蛉切、鶴丸國永這些新的伙伴一起在動蕩的時代投身到與時間溯行軍的戰斗中　　刀刃揮舞刀光劍影刀劍男士、即刻出陣